Repenser la robustesse et la fiabilité en recherche : les chercheurs face à la crise de la reproductibilité

Argumentaire

Les chercheurs sont confrontés au fait de ne pouvoir obtenir les mêmes résultats soit en reprenant les mêmes méthodes et/ou les mêmes données soit en s’appuyant sur de nouveaux jeux de données et/ou d’autres méthodes poursuivant le même objectif de recherche. Le problème de la fidélité et de la réitération des résultats se pose à l’échelle collective (i.e. unité de recherche, spécialistes d’une même discipline) comme individuelle (i.e. : reproductibilité spatio-temporelle (Desquilbet 2018).

Le sujet de la reproductibilité est ancien (Barba 2018) et d’aucuns considèrent qu’il vaut mieux évoquer un changement de paradigme de la recherche plutôt qu’une crise (Fanelli 2018). Il serait tentant de s’en référer à la conception poppérienne de la science selon laquelle l’erreur et sa réfutation résident au cœur même du processus scientifique. Mais le phénomène prend une ampleur telle que les notions mêmes de résultat et de fiabilité sont remises en cause. Si les réplications ne sont pas possibles, quelle est la valeur des travaux précédents s’ils s’avèrent non reproductibles (Zwaan et al. 2017) ?

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Publier : supports de présentation

La diffusion des supports de présentation sur le site de l’Urfist est soumise aux autorisations accordées par les intervenants. Tous les supports ne sont pas disponibles.

Supports de formation

Page mise à jour en mars 2021

Pourquoi tous les supports de cours ne sont-ils pas disponibles sur le site web de l’Urfist?

Les supports sont diffusés sur le site web de l’Urfist sous réserve des autorisations accordées par leur auteur.

Où consulter les supports des formations suivies ?

Lorsque le formateur fournit un support numérique, le document est consultable après la formation via le compte personnel. Pour chaque formation, un espace de consultation des documents est votre disposition ; vous pourrez y consulter les supports mais aussi des liens. Le compte personnel est accessible sur authentification et seules les personnes ayant effectivement assisté à la formation peuvent consulter les documents.

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Mon compte personnel

Page mise à jour en mars 2021

Dois-je me créer un compte utilisateur à chaque fois que je m’inscris à un stage?

Non, votre compte utilisateur est valable pour toutes les autres inscriptions auprès de toutes les Urfist. Si vous rencontrez des problèmes d’utilisation de la plateforme d’inscription, contactez-nous. La rubrique d’aide est disponible ici.

(Si vous avez déjà suivi des formations par le passé, pensez à vérifier que vous n’ avez pas déjà un autre compte sous un autre nom et/ou avec un statut différent, si tel est le cas, vous ne pourrez récupérer votre attestation de présence et devrez nous contacter).

J’ai perdu mon mot de passe pour m’inscrire en ligne, comment faire?

Vous pouvez le réinitialiser vous-même en cliquant sur « J’ai oublié mon mot de passe ».

Mes identifiants sont-ils ceux de l’université, ou du CNRS par exemple?

Oui, en choisissant l’option « Se connecter avec un compte universitaire », vous verrez la liste des établissements avec lesquels la connexion à la plateforme d’inscription de l’Urfist peut être effectuée.

Vous n’avez pas d’identifiants universitaire et il s’agit d’une première inscription? Cliquez sur « Je n’ai pas encore de compte ».

Se connecter à la page d’authentification.

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Fourniture de justificatifs, présence aux stages

Page mise à jour en mars 2021

Puis-je obtenir une attestation de présence? 

Oui, chaque participant reçoit par mail un message indiquant la mise à disposition de son attestation de présence. Le document mentionne entre autres : l’intitulé du stage, la date et le volume d’heures de formation reçu. Le document est à télécharger depuis son espace personnel de la plateforme d’inscription de l’Urfist. L’Urfist n’envoie pas les attestations aux écoles doctorales.

Puis-je suivre seulement une partie de la formation?

Non, il est très fortement déconseillé de n’assister que partiellement à un stage.

D’une part car la formation ne sera pas pleinement profitable au demandeur si elle est suivie partiellement.

D’autre part car cela pénalise les personnes sur liste d’attente qui pourraient bénéficier de la formation dans son intégralité.

Avant de vous inscrire, lorsque la formation dure plus de 3 heures notamment, merci de vous assurer que vous êtes disponible pour toute la durée de la formation.

J’ai besoin de fournir des attestations de présence pour des stages passés mais j’ai perdu les documents. Que faire?

Vos attestations sont disponibles dans votre compte personnel. Vous pouvez les télécharger. En cas de problème : urfist@u-bordeaux.fr

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To cheat or not to cheat : The dark side of data science

Objectifs

  • This meeting is not a lecture course, but an exchange session dedicated to unorthodox practices in the field of research and more particularly, in the field of data science, but not only.
  • If there is a (very) dark side of research practices, there are also subtle margins within it could be helpful to move forward. And this time, it’s not about tricking. It’s about being more understandable. When cheating is not cheating.

Talks are delivered in English.

Vidéos des interventions

Programme

The event is organized in partnership with the doctoral school “Mathematics and Computing”.

Talks are delivered in English. Contact : Sabrina Granger

This meeting is not a lecture course, but an exchange session dedicated to unorthodox practices in the field of research and more particularly, in the field of data science, but not only.

If there is a (very) dark side of research practices, there are also subtle margins within it could be helpful to move forward. And this time, it’s not about tricking. It’s about being more understandable. When cheating is not cheating.

The point of this workshop is to help you to know where you stand, to give you a compass in a tortured landscape.

Will you meet the challenge of orthodoxe research practices?

To start the fight, first, you should know your enemy : p-hacking, low statistical power, failure to control bias, poor quality control, falsified data, writing your own peer-review, but also working with predatory publishers, keeping your code veiled

Do you see patterns in random data (aka apophenia ; Munafò et al., 2017)? Do you have « the tendency to focus on evidence that is in line with our expectations or favoured explanation » (aka confirmation bias ; Munafò et al., 2017)? Or maybe have you heard of « the tendency to see an event as having been predictable only after it has occurred » (aka hindsight bias ; Munafò et al., 2017)?

But you also should be aware of the wide and sometimes surprising range of possibilities to produce more understandable results and thus, a better research. Get the grip, it’s up to you!

Nicolas Rougier : “Ten Simple Rules for Scientific Fraud & Misconduct”

Abstract : « We obviously do not encourage scientific fraud nor misconduct. The goal of this talk is to alert the audience to problems that have arisen in part due to the Publish or Perish imperative, which has driven a number of researchers to cross the Rubicon without the full appreciation of the consequences. Choosing fraud will hurt science, end careers, and could have impacts on life outside of the lab. If you’re tempted (even slightly) to beautify your results, keep in mind that the benefits are probably not worth the risks », (N. Rougier, J. Timmer 2017)

Nicolas Rougier est chercheur Inria en neurosciences computationelles travaillant à l’institut des maladies neurodégénératives à Bordeaux. Il a co-fondé le journal ReScience qui est spécialisé dans la publication de réplication en sciences computationelles.

Christophe Bontemps : « How To Lie With Graphics? »

Abstract : « According to Mark Twain « There are three kinds of lies: lies, damned lies, and statistics’’.  Today, with the emergence of so-called Data Science and self-proclaimed data scientists, we observe that graphical lies are everywhere.  They are even more powerful than spurious statistics. Many graphics in blogs, newspapers, and TV convey information that is misleading, by mistake or on purpose.  I propose a short tutorial to visual fallacies and lies. My goal here is not to encourage cheating and lying, but on the contrary to highlight the techniques used to elaborate misleading data visualizations.  This introduction should help researchers, citizens, (data) journalists and decision makers to distinguish visual lies from consistent graphics.  » Chr. Bontemps

Christophe Bontemps est ingénieur de recherche à l’INRA au sein de la Toulouse School of Economics. Economètre-Statisticien de formation, il enseigne la visualisation des données depuis plusieurs années et est co-organisateur du Meetup Toulouse Dataviz.

Sources

Munafò, Marcus R., Brian A. Nosek, Dorothy V. M. Bishop, Katherine S. Button, Christopher D. Chambers, Nathalie Percie du Sert, Uri Simonsohn, Eric-Jan Wagenmakers, Jennifer J. Ware, and John P. A. Ioannidis. 2017. ‘A Manifesto for Reproducible Science’. Nature Human Behaviour 1 (1): 0021. https://doi.org/10.1038/s41562-016-0021.

Rougier, Nicolas P., and John Timmer. 2017. “Ten Simple Rules for Scientific Fraud & Misconduct”. https://hal.inria.fr/hal-01562601.

Journées d’étude

La diffusion des supports de présentation sur le site de l’Urfist est soumise aux autorisations accordées par les intervenants.

PROGRAMME 2022

L’Urfist de Bordeaux n’a pas été en mesure, dû à la situation de pandémie, d’organiser de journées d’étude en 2020 et 2021.

PROGRAMME 2019

PROGRAMME 2018

PROGRAMME 2017

PROGRAMME 2016

PROGRAMME 2015

PROGRAMME 2014

PROGRAMME 2013

  • 03/12 : Tablettes et smartphones
  • 09/04 : Les aspects juridiques de la mise en ligne des documents numériques
  • 20/06 : La curation de données
  • 29/10 : L’écriture à l’heure d’Internet

PROGRAMME 2012

  • 07/02 : Valorisation des ressources pédagogiques numériques
  • 03/04 : Évolution des formats de catalogage : RDA, FRBR
  • 14/06 : Bibliothèques et Chercheurs en Sciences Humaines et Sociales
  • 04/12 : Les licences nationales

PROGRAMME 2011

  • 08/02 : Métadonnées et mutualisation des ressources : archives ouvertes, OAI-PMH, portails
  • 05/04 : Évolution des moteurs de recherche sur Internet : moteurs graphiques, visuels, navigation à facettes, recherche sémantique, etc.
  • 16/05 : Économie de l’attention : usages numériques et appropriation des connaissances
  • 06/12 : Nouveaux modes de diffusion de la recherche : publication, échanges d’information et réseaux

PROGRAMME 2010

  • 09/02 : Les Archives ouvertes
  • 10/06 : L’édition électronique, quels modèles économiques ?
  • 09/11 : Catalogues de bibliothèques : quel avenir ?
  • 07/12 : Droits d’auteurs et documents numériques

PROGRAMME 2009

  • 10/02 : Droit d’auteur et documents électroniques
  • 07/04 : ORI-OAI pour le référencement et l’ indexation des ressources numériques
  • 04/06 : Les logiciels libres en bibliothèque : où en sommes-nous ?
  • 06/10 : La numérisation
  • 08/12 : Bibliothèques numériques, XML et métadonnées
  • 05/05 : Journée coorganisée avec l’ADBS et l’ARPIST : Chercheurs et droits d’auteurs ou comment diffuser juridiquement et techniquement ses productions scientifiques

Formateurs

Page mise à jour en mars 2021

Je souhaiterais intervenir pour l’Urfist, comment faire?

Vous pouvez nous transmettre un CV récent ainsi qu’une lettre de motivation.

Qui sont les formateurs de l’Urfist?

L’Urfist fait appel à des enseignants-chercheurs et chercheurs, des personnels d’appui à la recherche, des professionnels de la documentation et des technologies de l’information et de la communication, des formateurs indépendants.

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Citer des références juridiques : guide et style Zotero de l’école doctorale Droit (Université de Bordeaux)

Consulter et emprunter le guide

Version imprimée et empruntable

Version numérique, téléchargeable

Télécharger le style automatisé (Zotero)

Démarrer avec le style

Le style bibliographique permet d’appliquer automatiquement les consignes du guide en utilisant les outils de rédaction bibliographique intégrés au logiciel, que ce soit pour :

  • créer des bibliographies indépendantes
  • gérer les citations dans un document (génération automatique des notes de bas de page et de la bibliographie en fin de document)

Utiliser le style

« Lire la notice d’utilisation? »

Lire une notice d’utilisation n’est généralement pas l’étape préférée quand on prend en main un outil, mais cette étape vous permettra de gagner du temps en adoptant d’emblée les bons réflexes, et en respectant quelques spécificités de saisie dans votre bibliothèque Zotero.
La section « Lisez-moi » comporte des indications pour le paramétrage et l’usage de Zotero, ainsi que des notes d’application générales communes à tous les types de document, à partir notamment des “Recommandations particulières” du guide.

Comment ajouter du texte dans vos notes de bas de page? Comment la génération automatique des mentions latines de renvoi est-elle paramétrée? Comment saisir dans votre bibliothèque Zotero les compléments de titre pour qu’ils soient affichés seulement en bibliographie et non en note de bas de page? C’est dans cette section que vous trouverez la réponse à ces questions.

La section “Modèles de citation des différents types de documents” comporte les indications détaillées pour chaque type de document cité. Elle intègre de plus des notes d’application dans Zotero et pour chaque exemple le lien vers le document correspondant dans la bibliothèque de groupe.
Comment saisir dans votre bibliothèque Zotero les contributeurs tels que les directeurs de thèse, les éditeurs scientifiques, etc.? Comment saisir dans votre bibliothèque Zotero des normes juridiques, des articles de presse ou de magazine? C’est dans cette section que vous trouverez la réponse à ces questions.

Aller + loin avec le style

Besoin d’aide?

Consulter la documentation en ligne

Contacter l’Urfist : urfist@u-bordeaux.fr

FAQ du guide et du style

D’où sont issues les préconisations du guide? Comment le guide a-t-il été conçu?

Les préconisations du guide sont issues d’une collaboration entre l’École doctorale de Droit de l’Université de Bordeaux et l’Urfist. Les auteurs du guide sont des : enseignants-chercheurs, des doctorants, des professionnels de l’information spécialisés dans le domaine du droit.

Vous souhaitez adapter cette démarche pour votre établissement? Consultez : Flamerie de Lachapelle, Frédérique. 2019. « Créer un style pour Zotero correspondant à une norme bibliographique juridique : retour d’expérience bordelais. Billet invité ». Billet. UrfistInfo (blog). 2 juillet 2019. https://urfistinfo.hypotheses.org/3305.

Je suis doctorant.e en droit à l’Université de Bordeaux. Suis-je obligé.e d’appliquer les consignes du guide?

Non. Il s’agit de préconisations, sans caractère obligatoire. S’appuyer sur ces recommandations permet de gagner du temps et de produire une bibliographie homogène et cohérente, plus lisible pour les lecteurs de votre thèse.

Les sites que j’utilise sont peu souvent compatibles avec Zotero. En général, j’ai un gros travail de reprise de données à prévoir. Est-ce la peine d’utiliser Zotero?

Absolument. Certes, le style conçu par l’ED Droit de l’Université de Bordeaux et l’Urfist ne résout pas le problème de la compatibilité entre Zotero et les sites web juridiques notamment. Il s’agit d’une autre question.

Une fois effectué le travail d’adaptation des données bibliographiques importées, vous n’avez pas à y revenir. La référence biblio est prête à l’emploi et réutilisable ad lib.

Utiliser Zotero permet de constituer une base de données personnelle de références bibliographiques interrogeable et facile à gérer sur le long terme. Les outils d’interrogation et d’organisation de Zotero sont puissants et simples à utiliser.

A la différence de l’outil de citation de Word par exemple, Zotero centralise en 1 seul endroit toutes vos références : 1 même référence peut être citée dans plusieurs fichiers sans que vous ayez à la créer de A à Z. Dans l’outil de Word, peu importe si vous avez déjà cité la référence : vous allez devoir la créer si vous ouvrez un nouveau fichier.

Si certains sites d’éditeurs juridiques n’offrent pas un niveau de compatibilité optimal, les données issues des catalogues de bibliothèques s’importent très facilement, sans scories ou lacunes majeures. Ainsi, toutes les références de monographies, de thèses, etc. issues de ces catalogues (ex. catalogue national des BU) s’importent aisément.

Dois-je obligatoirement utiliser la version automatisée des préconisations du guide?

Non, il n’y a aucune obligation. Il est tout à fait possible de traiter ses références manuellement. En effet, si vous avez déjà rédigé la majeure partie de votre manuscrit, il n’est pas forcément opportun de recourir au style automatisé car la reprise des références serait trop fastidieuse.

Si en revanche, vous entamez la rédaction, il est fortement conseillé de recourir au style automatisé. Il vous permettra de gérer plus facilement des volumes importants de sources, de les citer de manière cohérente automatiquement, de créer votre bibliographie finale en un clic, etc.

Je souhaiterais modifier le style. Est-ce possible?

Il convient de distinguer deux cas de figure.

  • Vous souhaitez modifier le style pour qu’il réponde mieux à vos besoins individuels. Vous pouvez alors créer un style dérivé du style « Université de Bordeaux – École doctorale de droit (Français) », en modifiant vous-même le fichier de code informatique CSL. Le billet du blog Zotero francophone « Apporter de petites modifications à un style bibliographique » pourra vous aider dans cette démarche.
  • Vous souhaitez proposer une évolution des consignes de rédaction bibliographique. Vous devez alors soumettre vos propositions à l’Urfist de Bordeaux, qui évaluera votre demande et y répondra au mieux. Il convient d’envisager un délai de plusieurs semaines ou plusieurs mois si la production d’une nouvelle édition du guide « Citer des références bibliographiques juridiques » s’avère nécessaire

Je suis intéressé.e par le style mais par où commencer? j’ai toujours traité mes références manuellement.

Une initiation à Zotero vous permettra de comprendre les finalités de l’outil et ses fonctionnalités principales. L’Urfist de Bordeaux propose régulièrement des formations. Il existe aussi une documentation abondante. Quelle que soit l’option que vous retenez, nous vous invitons fortement à vous former à Zotero pour installer et utiliser facilement le style de l’ED droit de l’Université de Bordeaux. Pas convaincu.e? Comprendre ce que Zotero peut vous apporter.

Inscriptions

Page mise à jour en mars 2021

Le stage qui m’intéresse est complet, il n’est plus possible de s’inscrire. Que faire?

Contactez l’Urfist pour être mis sur liste d’attente. En cas de désistements et en fonction de votre rang dans la liste d’attente, l’Urfist vous contactera pour vous proposer une place. La liste d’attente permet également à l’Urfist de contacter en priorité les personnes recensées lorsqu’un stage similaire est programmé de nouveau.

Il est également possible que le stage soit ré-ouvert en cas de nouvelle capacité ou de forts désistements, n’hésitez pas à nous contacter.

On me demande d’indiquer mon n° de téléphone dans mon compte personnel. Pourquoi est-ce important?

Il est préférable d’indiquer un numéro de téléphone pour pouvoir être joint.e par l’Urfist si une place s’est libérée suite à une annulation de dernière minute. Qui plus est, il se peut que dans le futur, on puisse vous alerter via ce biais pour vous donner toutes sortes d’informations importantes.

Je ne peux plus participer au stage auquel je m’étais inscrit. Comment me désister?

Les désistements s’effectuent depuis le compte personnel. A partir du 5ème désistement enregistré sur une année universitaire, l’Urfist se réserve le droit d’annuler les demandes d’inscriptions validées et/ou de refuser les autres demandes. En cas d’absence non justifiée, par un désistement ou un mail, cela pourra être dans un délais plus court que 5. Nous vous rappelons que d’autres personnes auraient pu bénéficier de votre place et vous remercions de prendre en compte cette information.

Je me suis inscrit(e) à une formation dont l’inscription n’est pas encore validée mais ne suis plus disponible. Comment annuler ma demande?

Vous pouvez annuler votre demande depuis le compte personnel. Vous n’avez pas d’autre démarche à effectuer. Si votre demande est acceptée, nous vous invitons à anticiper et à vous désister le plus rapidement possible, vous permettez ainsi à une personne sur liste d’attente de profiter de votre place. Plus ce désistement est fait en amont, meilleure sera la chance pour une autre personne de bénéficier de cette place.

Comment me tenir facilement informé des nouveaux stages et nouvelles sessions proposés?

Les annonces de stage sont diffusées par mail via les listes de diffusion des universités et des organismes de recherche.

Puis-je m’inscrire aux stages par mail?

Non, les demandes d’inscription doivent être effectuées en ligne. Les demandes adressées par mail ou téléphone ne sont pas prises en compte. En cas de problème pour accéder au compte personnel, contactez-nous.

J’ai fait une demande d’inscription en ligne, ma demande est-elle automatiquement acceptée?

Non. Dès validation définitive de votre demande, vous recevrez une notification automatique. Et à quelques semaines de la date du stage, vous recevrez un mail de convocation.

Les personnels de l’enseignement supérieur et des EPST doivent fournir une autorisation signée par leur supérieur hiérarchique.

Le stage auquel je souhaite assister n’est pas complet et je suis pourtant placé sur liste d’attente. Pourquoi?

2 cas de figure sont possibles : (1) soit l’effectif est complet et le demandeur est placé automatiquement sur la liste d’attente principale. Une fois que la liste d’attente principale est complète, dès lors, il n’est plus possible pour les demandeurs de procéder directement à leur inscription en ligne via la plateforme. Il faut dans ce cas envoyer une demande à l’Urfist qui placera le demandeur sur la liste d’attente complémentaire ; (2) soit le profil du demandeur ne correspond pas aux publics cibles du stage : en effet, certaines formations ciblent particulièrement les doctorants, les chercheurs ou les enseignants-chercheurs ; ou d’autres stages peuvent par exemple concerner en priorité les personnels des bibliothèques.

Afin de garantir la meilleure adéquation entre le contenu proposé et le profil des stagiaires, il est possible d’être mis sur liste d’attente par l’Urfist : la priorité est donnée aux participants correspondant au public cible.

La formation a lieu dans quelques jours, mais je n’ai pas reçu de mail de convocation, que faire?

Vérifiez l’adresse mail renseignée dans le compte utilisateur de la plateforme d’inscription. Si l’adresse mail est valide, contactez l’Urfist par mail dans les plus brefs délais.

Les formations de l’Urfist peuvent-elles être suivies dans le cadre du compte personnel de formation (dispositif ayant remplacé le Droit Individuel à la Formation – DIF)?

Oui, toutes les formations ne relevant pas de l’adaptation immédiate au poste peuvent être prises sur le quota d’heures du compte personnel de formation. Tout dépend de la nature du besoin de formation plus que du thème de la formation.

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